4月15日，携程于近日向美国证监会（SEC）提交了2016年年度报告，其中披露了携程的最新股权结构，以及近年来的重大的投资和并购活动。
百度仍为携程最大股东
2015年，携程与百度达成换股交易，控股去哪儿，交易完成后，百度成为携程最大股东。去年的年报数据显示，百度持有12,480,233.5股，持股比例为21.6%。
2016年年报显示，目前，百度仍为携程最大股东，持有携程20.1%的股份，但与2015年相比，持股比例略有下降。
在董事及管理层中，梁建章持股最多，为1.6%，其次为CEO孙洁，持有1.2%的股份（与2015年相比持股比例略有下降），范敏也为大的个人股东，持有携程1%的股份，沈南鹏由于持股未超过1%，因此未披露具体股份数。加上其他董事及高管层的个人持股，携程董事及管理层共持有4.1%的股份。
但持股比例下降这并非意味着百度或者孙洁减持。因为根据携程年报，总发行普通股从2015年的约5780万上升到2016年的6540万，因此，不管是百度还是孙洁，他们的实际持股数根据年报披露都是增加的，只是由于总股数增加，占比被摊薄了。
年报披露百度截至2016年3月31日持有12,480,233.5普通股；2017年2月28日持有13,144,917.5股。
财报中还披露了携程近年来的重大的投资和并购活动。
其中包括，2014年携程向途牛投资3000万美元，2015年再度投资约2000万美元，购买途牛A类普通股，至2016年年底携程持有途牛约4%的股份。
2015年1月携程完成对英国Travelfusion公司主要股权的收购，这家公司是英国领先的在线低成本航空内容整合平台和直连GDS解决方案供应商。
2015年携程从Expedia等股东手中收购艺龙的股权，以4.22亿美元购买了艺龙约38%的股权。2015年8月携程与腾讯公司共同参与艺龙私有化，并成为艺龙母公司China E-dragon Holdings的股东。随着这项交易的完成，携程成艺龙的最大股东，持股比例为37.6%
2015年10月艺龙与百度完成换股，携程从百度获得了去哪儿的178702519股A类普通股和11450000股B类普通股，携程拥有了去哪儿网约45%的投票权，而百度拥有携程普通股可代表约25%的投票权。
2015年底至2016年初，携程通过有限合伙及其他融资协议，投资几家专注投资中国企业的非美国投资机构。至2016年底，携程共计发行了620万股普通股并向其中部分公司投资了约13亿美元。
2016年1月携程向印度最大的在线旅行公司MakeMyTrip注资1.8亿美元，加上其他可转换债券，携程获得MakeMyTrip公司的26.6%的股票。2016年10月MakeMyTrip与印度Ibibo公司合并，携程将所有可转换债券转化为MakeMyTrip的普通股，获得其合并后公司的10%的股权。
2016年4月，携程宣布与中国东航达成战略合作，携程以30亿元参与认购东航股份非公开发行的约4.66亿股A股股票。此外，携程可以在未来进一步投资收购东航约10%的股份，并在东航董事会任命一名代表。
2016年12月，携程以12亿英镑现金及2亿英镑股票收购了英国旅行搜索网站天巡（Skyscanner）。收购完成后，天巡公司的原有管理层继续独立运营天巡公司。
携程在年报中透露，一直以来，携程都在有选择的投资或收购对自身具有互补价值的业务，未来也将会持续这么做。